PESQUISA VETERINÁRIA BRASILEIRA

Abstract in English:

The present study aimed to perform a systematic review to determine the antimicrobial resistance (AMR) profile of pathogenic Escherichia coli strains isolated from the intestinal tract of calves worldwide. Six databases were systematically searched (CABI, Cochrane, PubMed, SciELO, Scopus and Web of Science) with no restrictions regarding the year or place of the publications. A total of 932 studies were recovered, and 56 articles, published from 1982 to 2020, were included in this systematic review. These articles were selected based on title, abstract and full text. The most used technique to determine the susceptibility to antimicrobials of E. coli strains was the disk diffusion test (83.93%, 47/56), followed by the minimum inhibitory concentration (MIC) test (19.64%, 11/56). Only two studies (3.57%, 2/56) performed both tests. Seventy-seven different antimicrobial drugs of 17 classes were tested using disk diffusion methodology. For the MIC, fifteen antimicrobial classes and sixty-one antimicrobial drugs were tested. Cephalosporins were the most tested antimicrobial class, both by disk diffusion and MIC methods. Antimicrobial classes with the highest resistance levels were observed for tetracyclines, penicillins, folate inhibitors, aminoglycosides, phenicols and fluoroquinolones. Due to the heterogeneity and low quality of the studies, mainly regarding the antimicrobial susceptibility test methodology used, it was not possible to perform a meta-analysis. The findings showed the global spread of antimicrobial resistance in pathogenic E. coli from calves and indicate the importance of carrying out studies based on well-designed analyses to better understand the real emergence and spread of AMR in this pathogen.

• INDEX TERMS: Epidemiology Enterobacteriaceae cattle antimicrobial susceptibility enteropathogenic Escherichia coli

Abstract in Portuguese:

O presente estudo teve como objetivo realizar uma revisão sistemática para determinar o perfil de resistência antimicrobiana (RAM) de cepas patogênicas de Escherichia coli isoladas do trato intestinal de bezerros em todo o mundo. Foram pesquisadas sistematicamente seis bases de dados (CABI, Cochrane, PubMed, SciELO, Scopus e Web of Science) sem restrições quanto ao ano ou local das publicações. Foram recuperados 932 estudos, e 56 artigos, publicados entre 1982 e 2020, foram incluídos nesta revisão sistemática. Esses artigos foram selecionados com base no título, resumo e texto completo. A técnica mais utilizada para determinar a suscetibilidade aos antimicrobianos de cepas de E. coli foi o teste de difusão em disco (83,93%, 47/56), seguido pelo teste de concentração inibitória mínima (CIM) (19,64%, 11/56). Apenas dois estudos (3,57%, 2/56) realizaram ambos os testes. Setenta e sete diferentes antimicrobianos de 17 classes foram testados usando a metodologia de difusão em disco. Para o MIC, foram testadas quinze classes antimicrobianas e sessenta e um fármacos antimicrobianos. As cefalosporinas foram a classe antimicrobiana mais testada, tanto pelos métodos de difusão em disco quanto pelo MIC. As classes antimicrobianas com maiores níveis de resistência foram observadas para tetraciclinas, penicilinas, inibidores de folato, aminoglicosídeos, fenicóis e fluoroquinolonas. Devido à heterogeneidade e baixa qualidade dos estudos, principalmente quanto à metodologia de teste de suscetibilidade antimicrobiana utilizada, não foi possível realizar uma meta-análise. Os achados mostraram a disseminação global da resistência antimicrobiana em E. coli patogênica de bezerros e indicam a importância da realização de estudos baseados em análises bem delineadas para melhor compreender a real emergência e disseminação da RAM neste patógeno.

• Epidemiologia Enterobacteriaceae gado suscetibilidade antimicrobiana Escherichia coli enteropatogênica

Abstract in English:

ABSTRACT.- Silva A.P., Schmidt C., Vargas A.C., Maboni G., Rampelotto C., Schwab M.L., Escobar T.P. & Amaral A.S. 2014. [Antimicrobial susceptibility of Staphylococcus spp. isolated from canine superficial pyoderma.] Suscetibilidade antimicrobiana de Staphylococcus spp. isolados de cães com pioderma superficial. Pesquisa Veterinária Brasileira 34(4):355-361. Hospital Veterinário, Departamento de Clínica de Pequenos Animais, Centro de Ciências Rurais, Universidade Federal de Santa Maria, Av. Roraima 1000, Prédio 97, Camobi, Santa Maria, RS 97105-100, Brazil. E-mail: apsvet@hotmail.com A total of 154 samples of skin lesions were obtained from dogs with superficial pyoderma that were assisted by the Veterinary Dermatology Service at the University Veterinary Hospital (HVU), Universidade Federal de Santa Maria (UFSM), aiming to determine the antimicrobial susceptibility of Staphylococcus spp. isolates and evaluate the presence of multidrug resistance profile. After bacterial isolation and identification, the strains were tested for antimicrobial susceptibility, and the results showed lower percentages of resistance to the amoxicillin and clavulanic acid association (1.9%), cefadroxil (1.9%), cephalexin (1.9%) and vancomycin (0.6%). The highest percentages were towards amoxicillin (60.4%) and penicillin G (60.4%). The multidrug resistance was detected in 23.4% and the methicillin resistance in 5.8% of the samples. It may be concluded that the Staphylococcus spp. isolates present high susceptibility to key antimicrobials used in the treatment of superficial pyodermas in dogs at the HVU-UFSM, such as cephalexin and the amoxicillin and clavulanic acid association, confirming the preference for these drugs when treating dogs with this disorder. The susceptibility of the strains to fluoroquinolones, also recommended in the literature for the treatment of pyodermas, allows suggesting that such drugs should not be considered in the empirical selection. The identification of multidrug-resistant Staphylococcus spp. in the studied canine population justifies periodic and regional bacteriological tests of skin lesions in dogs with superficial pyoderma, possible therapeutic failures and also motivates wise use of antimicrobial therapy.

• Staphylococcus spp. skin infection infecção cutânea antimicrobianos

Abstract in Portuguese:

RESUMO.- Silva A.P., Schmidt C., Vargas A.C., Maboni G., Rampelotto C., Schwab M.L., Escobar T.P. & Amaral A.S. 2014. [Antimicrobial susceptibility of Staphylococcus spp. isolated from canine superficial pyoderma.] Suscetibilidade antimicrobiana de Staphylococcus spp. isolados de cães com pioderma superficial. Pesquisa Veterinária Brasileira 34(4):355-361. Hospital Veterinário, Departamento de Clínica de Pequenos Animais, Centro de Ciências Rurais, Universidade Federal de Santa Maria, Av. Roraima 1000, Prédio 97, Camobi, Santa Maria, RS 97105-100, Brazil. E-mail: apsvet@hotmail.com Foram obtidas 154 amostras de lesões cutâneas de cães com pioderma superficial atendidos no Serviço de Dermatologia Veterinária do Hospital Veterinário Universitário (HVU) da Universidade Federal de Santa Maria (UFSM), com o objetivo de determinar a suscetibilidade antimicrobiana de isolados de Staphylococcus spp. e avaliar a presença de multirresistência. Após isolamento e identificação, as cepas foram submetidas ao teste de sensibilidade aos antimicrobianos, cujos resultados evidenciaram menores percentuais de resistência à associação amoxicilina e ácido clavulânico (1,9%), cefadroxil (1,9%), cefalexina (1,9%) e vancomicina (0,6%). Os maiores percentuais de resistência foram frente à amoxicilina (60,4%) e penicilina G (60,4%). A multirresistência foi detectada em 23,4% e a resistência à meticilina em 5,8% das amostras. Pode-se concluir que os isolados de Staphylococcus spp. apresentam elevada suscetibilidade aos antimicrobianos comumente utilizados no tratamento dos piodermas superficiais em cães atendidos no HVU-UFSM, como a cefalexina e a amoxicilina associada ao ácido clavulânico, confirmando a eleição desses fármacos para o tratamento de cães com esta afecção. A suscetibilidade diminuída das cepas frente às fluoroquinolonas, também recomendadas pela literatura para o tratamento de pioderma, permite sugerir que estes fármacos não devem mais ser considerados na seleção empírica. A identificação de Staphylococcus spp. multirresistentes na população canina estudada justifica análises bacteriológicas periódicas e regionais de lesões cutâneas de cães com pioderma superficial, a fim de minimizar a seleção de bactérias resistentes, possíveis falhas terapêuticas e também motiva a antimicrobianoterapia prudente.

Abstract in English:

ABSTRACT.- Girardini L.K., Gressler L.T., Costa M.M., Botton S.A., Pellegrini D.C.P. & Vargas A.C. 2013. [Susceptibility profile of Brazilian Rhodococcus equi isolates to different antimicrobial classes and the presence of vapA gene.] Perfil de suscetibilidade antimicrobiana e presença do gene vapA em Rhodococcus equi de origem humana, ambiental e equina. Pesquisa Veterinária Brasileira 33(6):735-740. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva, Centro de Ciências Rurais, Universidade Federal de Santa Maria, Camobi, Santa Maria, RS 97105-900, Brazil. E-mail: agueda@ccr.ufsm.br Rhodococcus equi is a facultative intracellular bacterium and etiological agent of rodococosis, an important disease that affects specially foals under six months old and leading the death generally due to pulmonary lesions. R. equi also has zoonotic potential, and it has emerged as an opportunistic pathogen in the world, specially infecting solid organ transplant recipients and immunocompromised human patients, mainly those infected by human immunodeficiency virus (HIV). Additionally, R. equi infections by healthy hosts have been reported principally in children and elderly individuals. Studies have shown an increasing level of resistance of isolates of R. equi against antibiotics commonly used to treat affected animals and humans. The virulence of this agent is associated with a protein located on a plasmid, designated vapA, it is essential for survival and replication of R. equi within macrophages. The present study evaluated the susceptibility profile of R.equi isolates from different sources against the antimicrobials most commonly used to treat animals and humans, as well as the occurrence and association of vapA gene and the antimicrobial multiple resistance index (AMRI). Sixty-seven Brazilian isolates of R. equi from different sources were analyzed: 30 clinical samples of horses, seven of human and 30 of environmental (six from soil and 24 from horse feces). To evaluate the susceptibility profile of R. equi isolates, the Kirby Bauer method was performed by using 16 drugs of 11 distinct antimicrobials classes. Additionally, those samples were also resistant to macrolides (azithromycin 6.7%, erythromycin 6% and clarithromycin 3.3%) as well as rifamycin (13%). All human and environmental samples were sensitive to macrolides and rifamycin. However, environmental isolates demonstrated high levels of resistance to penicillin and chloramphenicol. Similarly, human isolates had high level of resistance to ceftiofur, lincomycin and sulfazotrim. AMRI in all R. equi isolates ranged 0 to 0.67, in clinical samples of horses the AMRI mean value obtained was 0.19, in environmental was 0.14 and in human isolates was 0.1. Despite of high sensitivity observed in most Brazilian R. equi isolates analyzed, it was verified in clinical samples of horses different levels of resistance against all antibiotics commonly used in the treatment of rodococosis. In contrast, environmental isolates not demonstrated any resistance against antimicrobials employed in equine rodococosis therapy. In addition, in human isolates it was not observed resistance against drugs for restricted use in human rodococosis therapy. Based on the AMRI achieved in clinical horse isolates, we highlight the importance of restrictive measures and more caution to use antimicrobial drugs in R. equi infections to avoid increasing of new multidrug-resistant strains.

• Rodococcosis Rhodococcus equi rodococose

Abstract in Portuguese:

RESUMO.- Girardini L.K., Gressler L.T., Costa M.M., Botton S.A., Pellegrini D.C.P. & Vargas A.C. 2013. [Susceptibility profile of Brazilian Rhodococcus equi isolates to different antimicrobial classes and the presence of vapA gene.] Perfil de suscetibilidade antimicrobiana e presença do gene vapA em Rhodococcus equi de origem humana, ambiental e equina. Pesquisa Veterinária Brasileira 33(6):735-740. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva, Centro de Ciências Rurais, Universidade Federal de Santa Maria, Camobi, Santa Maria, RS 97105-900, Brazil. E-mail: agueda@ccr.ufsm.br Rhodococcus equi é um micro-organismo intracelular facultativo, agente etiológico da rodococose, uma importante enfermidade que acomete principalmente potros com menos de seis meses de idade, causando a morte geralmente em decorrência de lesões pulmonares. Este agente também tem potencial zoonótico e emergiu como um patógeno oportunista no mundo, acometendo humanos imunocomprometidos, especialmente os transplantados e infectados pelo vírus da imunodeficiência humana (HIV). Entretanto, infecções por R. equi em hospedeiros hígidos tem sido relatadas, principalmente em crianças e idosos. Estudos tem mostrado um nível crescente na resistência de isolados de R. equi em relação aos antimicrobianos comumente utilizados no tratamento de animais e seres humanos infectados por este agente. A virulência deste pode estar associada a fatores como a cápsula de polissacarídeo, fosfolipase C e à enzima colesterol oxidase (fator equi). No entanto, uma proteína localizada em um plasmídeo, designada vapA, é essencial para a sobrevivência e replicação do agente em macrófagos. Com isso, os objetivos deste estudo foram avaliar o perfil de suscetibilidade de isolados de R. equi de diferentes fontes em relação aos antimicrobianos mais comumente utilizados na terapêutica animal e humana, bem como verificar a associação entre a presença do gene vapA e o índice de resistência múltipla aos antimicrobianos (IRMA). Neste estudo, 67 isolados brasileiros de R. qui de diferentes fontes foram analisados: 30 provenientes de amostras clínicas de equinos, sete de humanos e 30 ambientais (seis do solo e 24 de fezes de equinos). Para avaliar o perfil de suscetibilidade dos isolados utilizou-se o método de disco difusão, sendo testadas 16 drogas de diferentes classes de antimicrobianos. As amostras clínicas de equinos apresentaram as maiores taxas de resistência à penicilina (86,7%) e lincomicina (30%). Além disso, foram também resistentes a macrolídeos (azitromicina a 6,7%, eritromicina a 6% e claritromicina a 3,3%) e rifamicina (13%). Todas as amostras humanas e ambientais foram sensíveis aos macrolídeos e rifamicina. Contudo, isolados ambientais demonstraram níveis elevados de resistência à penicilina e cloranfenicol. Da mesma forma, os isolados humanos apresentaram alto nível de resistência ao ceftiofur, lincomicina e sulfazotrim. O IRMA em todos os isolados de R. equi variou de 0 a 0,67, tendo como valores médios 0,19 para as amostras clínicas de equinos, 0,14 nas ambientais e em isolados humanos foi de 0,1. Apesar da alta sensibilidade observada nos isolados analisados, verificaram-se diferentes níveis de resistência nas amostras clínicas de equinos. Em contraste, os isolados ambientais não demonstraram resistência em relação aos agentes antimicrobianos utilizados na terapia da rodococose equina. Além disso, em isolados humanos não se observou resistência contra a droga para uso restrito em terapia de humano. Com base no IRMA observado em isolados clínicos de equinos, destacamos a importância de medidas restritivas e mais cautela na utilização de antimicrobianos em infecções causadas por R. equi para evitar o aumento de novas cepas multirresistentes.