Abstract in English:
In Brazil, the Atlantic Forest has been suffering from deforestation, which has had impacts on its flora, fauna, and microbiota. However, the fungal diversity present in these environments is little known and studied. In this study, a total of 90 samples of 45 wild birds (45 feathers and 45 feces) were collected in Ilha da Marambaia, southeastern Brazil. Filamentous fungi isolated from these samples were identified through macroscopic and microscopic characteristics. Some isolates were identified by molecular biology using the PCR technique. Acremonium, Alternaria, Aspergillus, Cunninghamella, Curvularia, Eurotium, Fusarium, Geotrichum, Neosartorya, Pestalotia, Paecilomyces, Penicillium, Rhizopus, Mucor and Syncephalastrum were identified. These results indicate the presence of saprophytic fungi species in the feathers and feces of wild birds of the capture site. Further studies should be conducted to elucidate if the mycobiota profile modifies with anthropization and if it interferes with bird health and environmental recovery.
Abstract in Portuguese:
No Brasil, a Mata Atlântica vem sofrendo com o desmatamento, que tem impactado sua flora, fauna e microbiota. No entanto, a diversidade fúngica presente nesses ambientes é pouco conhecida e estudada. Neste trabalho, um total de 90 amostras de 45 aves silvestres (45 penas e 45 fezes) foram coletadas na Ilha da Marambaia, Sudeste do Brasil. Fungos filamentosos isolados dessas amostras foram identificados por meio de características macroscópicas e microscópicas. Alguns isolados foram identificados por biologia molecular usando a técnica de PCR. Foram identificados Acremonium, Alternaria, Aspergillus, Cunninghamella, Curvularia, Eurotium, Fusarium, Geotrichum, Neosartorya, Pestalotia, Paecilomyces, Penicillium, Rhizopus, Mucor e Syncephalastrum. Esses resultados indicam a presença de espécies de fungos saprofíticos nas penas e fezes de aves silvestres do local de captura. Novos estudos devem ser realizados a fim de elucidar se o perfil da micobiota se modifica com a antropização e se interfere na saúde das aves e na recuperação ambiental.
Abstract in English:
Traumatic injuries are a significant cause of death for birds worldwide, as they are at an increased risk of collisions and other injuries due to man-made environments. This study examined the frequency and morphological characteristics of fatal traumatic injuries in endemic and migratory Passeriformes and Psittaciformes from the Cerrado Biome, a biodiverse but threatened area in Brazil. Results showed that fatal traumatic injuries were found in 21.8% of birds (285/1305), mainly in spring and summer, during the birds’ reproductive period. The yellow-chevroned parakeet (Brotogeris chiriri) and Passeriformes from the Thraupidae family were the most affected. Nearly 70% of the fatal injuries observed were to the thoracic, pelvic limbs, and skull, and types of fractures and affected bones were thoroughly evaluated. Blunt traumas were one of the most frequent causes of injuries. Injuries affecting the appendicular skeleton and head represented significant causes of traumatic death for Passeriformes and Psittaciformes. The frequency of these fatal injuries has been increasing in recent years, which may be related to the remarkable environmental changes in the Cerrado Biome and jeopardize the survival of many bird species.
Abstract in Portuguese:
As lesões traumáticas são uma causa significativa de morte nas aves em todo o mundo, pois apresentam um risco maior de colisões e outras lesões devido aos ambientes degradados e criados pelo homem. Este estudo examinou a frequência e as características morfológicas das lesões traumáticas fatais em Passeriformes e Psittaciformes endêmicos e migratórios do Bioma Cerrado, uma área com rica biodiversidade, mas ameaçada no Brasil. Os resultados demostraram que as lesões traumáticas fatais foram observadas em 21,8% das aves (285/1305), principalmente na primavera e verão, durante a época reprodutiva das aves. O periquito-do-encontro-amarelo (Brotogeris chiriri) e Passeriformes da família Thraupidae foram as aves mais frequentemente acometidas. Por volta de 70% das lesões fatais observadas foram nos membros torácicos e pélvicos, e crânio, e os tipos de fraturas e ossos afetados foram minuciosamente avaliados. Os traumas contudentes foram as principais causas das lesões. As injúrias que afetaram o esqueleto apendicular e a cabeça representaram as mais importantes causas de morte traumática para Passeriformes e Psittaciformes. A frequência dessas lesões fatais vem aumentando nos últimos anos, o que pode estar relacionado às mudanças ambientais marcantes no Bioma Cerrado e colocar em risco a sobrevivência de muitas espécies de aves.
Abstract in English:
Avian influenza viruses (AIVs), Newcastle disease virus (NDV), West Nile virus (WNV), adenovirus (AV) and herpesvirus (HV) play an important role in the health of human and animal populations. However, knowledge of the prevalence of these viruses in wild birds is restricted to some groups (e.g. shorebirds) or regions worldwide. Information on grassland birds of South America, which is essential for their conservation, is scarce. The objectives of the present study were to evaluate occurrences of AIV, NDV, WNV, AV and HV for the first time in a bird community of a unique protected area in southern Brazil, which is home for the critically endangered yellow cardinal (Gubernatrix cristata), and captive yellow cardinals from fauna maintainers of the Brazilian Captive Program of the Yellow Cardinal. Passerine species of wild life were caught, identified and samples (swabs) were collected from the oropharynx and cloaca of 64 passerines of 26 species (including 3 yellow cardinals) and 30 yellow cardinals of captive, for molecular diagnosis. The samples were subjected to RNA and DNA extraction and the real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) for AIV, NDV and WNV and nested PCR for AV and HV. One yellow cardinal of captive presented a positive result for AV, this result is important for planning, managing natural attributes and making decisions in relation to integrated conservation of threatened species. This is the first report of AV in yellow cardinal and epidemiological investigation of viruses in wild passerines of the Pampa biome, in Rio Grande do Sul, Brazil.
Abstract in Portuguese:
Os vírus da gripe aviária (VGA), vírus da doença de Newcastle (VDN), vírus do Nilo Ocidental (VNO), adenovírus (AV) e herpesvírus (HV) desempenham um papel importante na saúde das populações humana e animal. No entanto, o conhecimento da prevalência desses vírus em aves selvagens é restrito a alguns grupos (por exemplo, aves limícolas) ou regiões em todo o mundo. As informações sobre as aves campestres da América do Sul, essenciais para a sua conservação, são escassas. Os objetivos do presente estudo foram avaliar a ocorrência de VGA, VDN, VNO, AV e HV pela primeira vez em uma comunidade de aves de uma área única protegida no Sul do Brasil, que abriga o cardeal-amarelo (Gubernatrix cristata) criticamente ameaçado de extinção e em cardeais-amarelos de cativeiro dos mantenedores de fauna do Programa Brasileiro de Cativeiro do Cardeal-amarelo. Espécies de passeriformes silvestres foram capturadas, identificadas e amostras (swabs) foram coletadas da orofaringe e cloaca de 64 passeriformes de 26 espécies (incluindo 3 cardeais-amarelos) e 30 cardeais-amarelos de cativeiro, para diagnóstico molecular. As amostras foram submetidas à extração de RNA e DNA e à reação em cadeia da polimerase em tempo real (RT-PCR) para VGA, VDN e VNO e nested PCR para AV e HV. Um cardeal-amarelo de cativeiro apresentou resultado positivo para AV, este resultado é importante para o planejamento, manejo dos atributos naturais e tomada de decisões em relação à conservação integrada de espécies ameaçadas. Este é o primeiro relato de AV em cardeal-amarelo e de investigação epidemiológica de vírus em passeriformes silvestres do bioma Pampa, no Rio Grande do Sul, Brasil.